Biología de Sistemas y Filosofía del Cáncer

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Resumen

Nuestro grupo explora diferentes dimensiones asociadas al conjunto de patologías que reciben la denominación de “cáncer”. Para entender cómo se desarrolla el proceso oncogénico combinamos biología molecular, de sistemas y bioinformática, utilizando microscopía confocal, de super-resolución y reporteros fluorescentes que nos permiten analizar la localización subcelular y las dinámicas de activación de proteínas de señalización celular en células tumorales individuales y en tiempo real, así como la variabilidad célula-célula y la heterogeneidad fenotípica. Asimismo, para analizar cuándo y dónde se origina el cáncer mediante el enfoque de la toxicología de sistemas, investigamos cómo los herbicidas y pesticidas influyen en el desarrollo de procesos tumorales, analizando la relación entre ciencia, tecnología, modo de producción y cáncer. Para estudiar cómo entendemos el cáncer, en términos epistemológicos, nuestro grupo analiza la agenda de investigación en cáncer, intentando revertir la actual marginación de la prevención y de los determinantes sociales y ambientales del cáncer en dicha agenda. Por último, para entender qué es el cáncer, cuál es la naturaleza de este fenómeno, utilizamos modelos matemáticos y bases de datos para analizar la influencia de las dinámicas eco-evolutivas y los estilos de vida de cada especie en la tasa de incidencia de cáncer en mamíferos.

Líneas de investigación

AKT es una kinasa que cumple múltiples funciones en diversos compartimentos subcelulares y se encuentra desregulada en tumores. Generamos un análisis espacial de la red de interactomas de AKT para construir un atlas de las localizaciones subcelulares de AKT como herramienta predictiva de las funciones fisiológicas y patológicas de AKT en cada compartimento. Encontramos un subconjunto de sustratos e interactores de AKT vinculados a speckles nucleares (NS), splicing de ARNm, así como al sistema endomembrana (Golgi, retículo endoplásmico y lisosoma), la respuesta al estrés, la autofagia y diferentes tipos de cáncer. El uso de reporteros fluorescentes, microscopía confocal y de super-resolución nos permite profundizar estos análisis.

Nuestro grupo reportó por primera vez que Akt es capaz de sufrir S-palmitoilación, una modificación covalente reversible que afecta su localización y función. Nos proponemos evaluar la localización subcelular de mutantes de Akt1 incapaces de ser palmitoilados así como su efecto en la apoptosis, proliferación, migración y resistencia a drogas antitumorales en líneas celulares normales y tumorales. Además, nos encontramos estudiando cuáles son las palmitoil-transferasas que regulan la palmitoilación de Akt y cómo afecta una mayor palmitoilación las funciones de Akt. Mediante dinámicas de simulación molecular pretendemos comprender la influencia de esta modificación en la estructura de Akt.

La respuesta a proteínas mal plegadas (Unfolded Protein Response o UPR) involucra la activación de tres vías paralelas (IRE1, PERK y ATF6) y se dispara ante la acumulación de proteínas mal plegadas en el retículo endoplásmico. Nos proponemos caracterizar la dinámica de activación de diferentes reporteros de UPR desarrollados en nuestro laboratorio. Dentro de estos objetivos nos proponemos, además, estudiar el cross-talk entre las vías de Akt, SRC y UPR y analizar si TDP-43, una proteína asociada a enfermedades neurodegenerativas tales como esclerosis lateral amiotrófica (ELA) y demencia frontotemporal (DFT), es capaz de modular la activación de la UPR.

El objetivo es evaluar los potenciales efectos toxicológicos ocasionados sobre la salud humana de herbicidas de uso común en la Argentina. Se busca estudiar, de manera comparativa, los efectos toxicológicos de diferentes herbicidas. Para ello, utilizando STRING, STITCH y DisGeNET, se realiza un análisis bioinformático para estudiar las principales proteínas, procesos biológicos y enfermedades asociadas a estos herbicidas. Estos análisis son complementados con estudios experimentales utilizando reporteros fluorescentes, transcriptómica y citometría de flujo (SUNSET). En particular, la desregulación de las vías de Akt y UPR se ha vinculado tanto al desarrollo de distintos tipos de cánceres como al impacto de herbicidas.

 

El objetivo es analizar el lugar que ocupan los determinantes sociales y ambientales del cáncer en la actual agenda de investigación en cáncer. Nos encontramos realizando un análisis léxico y bibliográfico de los trabajos científicos publicados en Argentina y otros países para evaluar a) cuáles son los términos y palabras clave más frecuentes en estos trabajos; y b) qué tipo de revistas y líneas de investigación abordan el tema. Además, a través de actividades docentes, de relevamiento y de vinculación en la Práctica Social Educativa “Aspectos Sociales del Cáncer”, abordamos cáncer, marginación social y otros aspectos sociales relevantes.

Nuestra hipótesis de trabajo es que la propensión a desarrollar cáncer podría estar finamente modulada por la evolución: una elevada incidencia de cáncer podría tener un valor adaptativo neutro, negativo o incluso positivo, dependiendo de la especie y el contexto. Mediante el uso de bases de datos públicas, demostramos que las especies de mamíferos con hábitos cooperativos y solidarios tienen menor riesgo de cáncer. Utilizando modelado matemático, comprobamos que tasas de mortalidad más elevadas en individuos de mayor edad o post-reproductivos pueden conducir a un aumento del tamaño de la población (efecto hidra) en un contexto de competencia intraespecífica.

Galería:

Integrantes:

Mercedes García Carrillo

mercedesgcarrillo@gmail.com
Investigadora Asistente CONICET
 (Ingreso a CIC aprobado en 2023)

Antonella Vila

antonella.s.vila@gmail.com
Becaria doctoral CONICET

Gonzalo Sanchez

gonzalomsanchez.92@gmail.com
Becario doctoral CONICET
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Calén N. Sansalone

Tesista de Licenciatura

Emiliano Martínez Viademonte

Estudiante

Francisco Gelman Constantin

Becario Posdoctoral
Beca Agencia

Analía Amante

analiaterra@yahoo.com.ar
Becaria doctoral CONICET

Catalina Sierra

catalinasierra9@gmail.com
Becaria Estímulo UBA
Tesista de Licenciatura

Tomás Lorusso

Estudiante

Codirección

Florencia Cascardo
Becaria posdoctoral CONICET
florycascardo@hotmail.com
Directora: Virginia Novaro

Mauricio Montenegro
Becario posdoctoral CONICET
mauricio.montenegro909@gmail.com
Director: Lionel Muller Igaz

Notas de divulgación

Publicaciones Seleccionadas

  • García Carrillo, M., Gagnon, M. A., & Blaustein, M. (2024)
    Current priorities in health research agendas: tensions between public and commercial interests in prioritizing biomedical, social, and environmental aspects of health.
    Frontiers in Medicine, 11, 1391982
    https://doi.org/10.3389/fmed.2024.1391982
  • Blaustein, M., & Garelli, F. M. (2023)
    What about Health Education? Hegemony, paradigms in tension and alternatives.
    Frontiers in Medicine, 10, 1289865
    https://doi.org/10.3389/fmed.2023.1289865
  • Suaya, M., Sánchez, G. M., Vila, A., Amante, A., Cotarelo, M., García Carrillo, M., & Blaustein, M. (2022)
    Live and let die: signaling AKTivation and UPRegulation dynamics in SARS-CoVs infection and cancer.
    Cell Death & Disease, 13(10), 846
    https://doi.org/10.1038/s41419-022-05250-5
  • Carrillo, M. G., Testoni, F., Gagnon, M. A., Rikap, C., & Blaustein, M. (2022)
    Academic dependency: the influence of the prevailing international biomedical research agenda on Argentina’s CONICET.
    Heliyon, 8(11)
    https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2022.e11481
  • Testoni, F. E., García Carrillo, M., Gagnon, M. A., Rikap, C., & Blaustein, M. (2021)
    Whose shoulders is health research standing on? Determining the key actors and contents of the prevailing biomedical research agenda.
    PloS one, 16(4), e0249661
    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0249661
  • Blaustein, M., Piegari, E., Martínez Calejman, C., Vila, A., Amante, A., Manese, M. V., … & Colman-Lerner, A. (2021)
    Akt is S-palmitoylated: a new layer of regulation for Akt.
    Frontiers in Cell and Developmental Biology, 9, 626404
    https://doi.org/10.3389/fcell.2021.626404
  • Argentinian AntiCovid Consortium (2020)
    Structural and functional comparison of SARS-CoV-2-spike receptor binding domain produced in Pichia pastoris and mammalian cells.
    Scientific reports, vol. 10, no 1, p. 21779
    https://doi.org/10.1038/s41598-020-78711-6
  • Blaustein, M., Wirth, S., Saldaña, G., Piantanida, A. P., Bogetti, M. E., Martin, M. E., … & Uchitel, O. D. (2020)
    A new tool to sense pH changes at the neuromuscular junction synaptic cleft.
    Scientific Reports, 10(1), 20480
    https://doi.org/10.1038/s41598-020-77154-3
  • Blaustein, M., Pérez-Munizaga, D., Sánchez, M. A., Urrutia, C., Grande, A., Risso, G., … & Colman-Lerner, A. (2013)
    Modulation of the Akt pathway reveals a novel link with PERK/eIF2α, which is relevant during hypoxia.
    PLoS One, 8(7), e69668
    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0069668
  • Blaustein, M., Pelisch, F., Tanos, T., Munoz, M. J., Wengier, D., Quadrana, L., … & Srebrow, A. (2005)
    Concerted regulation of nuclear and cytoplasmic activities of SR proteins by AKT.
    Nature structural & molecular biology, 12(12), 1037-1044
    https://doi.org/10.1038/nsmb1020

Colaboradores

Natalia Rubinstein
iB3

Virginia Novaro
IBYME

Alejandro Colman-Lerner
IFIBYNE

Alejandra Ventura
IFIBYNE

Alan Szalai
CIBION

Fernando Stefani
CIBION

Osvaldo Uchitel
IFIBYNE

Anabella Srebrow
IFIBYNE

Ricardo Biondi
IBIOBA

Ari Zeida
Instituto Pasteur (Uruguay)

María Corvi
INTECH

Vanesa Galassi
UNCuyo

Gonzalo Solís
University of Geneva (Suiza)

Lionel Muller Igaz
IFIBIO Houssay

Alejandro Amoroso
Universidad de San Sebastián (Chile)

Cecilia Rikap
University College London (United Kingdom)

Ignacio Schor
IFIBYNE

Laura Kamenetzky
iB3

Ezequiel Petrillo
IFIBYNE

Javier Santos
iB3

Nicolás Lavagnino
UBA/CONICET

Constanza Sánchez de la Vega
Instituto del Cálculo

Nicolás Flaibani
IEGEBA

Rainer Pepperkok
EMBL (Alemania)